肛窦炎又称肛隐窝炎、肛腺炎，常是肛管直肠部位感染性疾病的发源病灶。直肠从中部往下端逐渐变细缩窄，随着肠腔在肛门处的收缩，肠壁的粘膜就像人衣服的袖口一样折叠起来，形成许多纵长隆起的皱襞，医学上叫直肠柱或肛柱。两个柱底之间靠一个半月形皱襞相连，这个半月形皱襞叫肛门瓣。两个直肠柱与肛门瓣之间形成了一个漏斗状开口向上的凹陷小窝，这个小窝就是肛窦，又叫肛隐窝。
初起可以采取保守疗法。祖国医学认为此病多以湿热下注，大肠热毒多见。临床辨证施治，一般多用五味消毒饮和黄连解毒汤化裁，成药可以选用牛黄解毒片、连翘败毒丸、二妙丸等。或服用先锋霉素、磺胺类药物控制感染。外用安氏熏洗剂坐浴熏洗，肛门内可用痔疮栓、京万红等消炎。
药物治疗无效，局部炎症不减轻，反复发作者，可考虑手术治疗。肛窦炎可施行肛窦切除术，即在局麻下，将感染的肛窦切开，创面不缝合，外用油纱条压迫止血固定。术后每天坐浴，局部换药，一般7～10天伤口愈合。肛乳头切除术：小的肛乳头可直接切除，乳头大的则需要用线结扎基底部后切除。
肛窦炎是引起多种肛门直肠疾病的祸根，应当重视对它的预防和治疗。慢性肠道炎症，如痢疾、肠结核、溃疡性大肠炎、克隆氏病、蛲虫等的感染刺激；习惯性便秘、大便在直肠内积存时间过久，堵塞肛窦；或大便干燥硬结，排便时损伤肛窦，使细菌感染，都是引起肛窦炎的常见原因。
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