肛瘘是肛门直肠瘘的简称，是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。肛瘘是脓肿后时代，是一个疾病的两个阶段。
典型的肛瘘就是一根通畅的完整的管道，一头在肛窦，一头在肛缘外，或在直肠壁。非典型肛瘘一般只有内口而没有外口，或虽有内口又有外口，但中间瘘管闭塞，或只有外口，内口找不到，或干脆就只有一硬结。
肛瘘占肛肠病的发病年龄以20～40岁青壮年为主。婴幼儿发病者亦不少见，主要见于男孩，女孩少见，男女孩比例为5：1。
第一个阶段
肛隐窝、肛门瓣感染发炎。开始仅限于局部的炎症，这时若未能及时治疗，炎症会向肛门周围蔓延。
第二个阶段
炎症从局部的肛隐窝和肛门瓣开始，逐渐蔓延扩散，形成肛门直肠周围炎。假如炎症不能得到控制，就可能侵入到抗病能力低的组织间隙之中。
第三个阶段
鉴于肛门直肠周围组织间隙的抗病能力下降，便成为病菌入侵、扩散、积聚繁殖的地方，致使这里的组织容易感染发炎，正不胜邪，而形成肛门直肠周围脓肿。
第四个阶段
肛瘘是肛肠疾病中比较严重的一种，作为一种高发性肛门疾病，肛瘘的发病率仅次于痔疮。其危害也比其他肛肠疾病要大的多，在发生肛瘘时，患医院明确病情，否则肛瘘不及时治疗会引发更为严重的后果。
肛瘘的危害，大致总结为以下四个一、感染流脓
肛瘘一旦形成，自愈的机会极少，并带来一系列的危害。首先肛瘘感染发炎后，肛门疼痛剧烈，溃破后脓水污染内裤，脓汁刺激局部皮肤，肛门瘙痒剧烈。
二、瘘口、瘘管增加
肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
三、癌变危险
肛瘘的多发性，可形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。
四、肛门失禁
任由肛瘘发展，可对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症不久再次发作，被迫沦为“二手患者”。
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